Laboratórium molekulovej termodynamiky je orientované prevažne na modelovanie vlastností polymérnych materiálov. Pomocou Monte Carlo simulácií na mriežke a iných techník po?íta?ového modelovania re?azcov sa skúmajú štruktúrne, termodynamické, povrchové a mechanické vlastnosti syntetických polymérov a biopolymérov. Pri experimentálnom sledovaní týchto vlastností laboratórium úzko spolupracuje s inými skupinami na Ústave polymérov.